Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LATO43561 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LATO43561 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LATO43561 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LATO43561 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LATO43561 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LATO43561 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LATO43561 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LATO43561 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LATO43561 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LATO43561 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LATO43561 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LATO43561 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LATO43561 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LATO43561 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LATO43561 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LATO43561 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LATO43561 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms