Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHGDHO43175 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms