Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VWA5AO00534 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA5AO00534 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA5AO00534 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms