Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF5O00463 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF5O00463 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF5O00463 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF5O00463 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF5O00463 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms