Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
O00370 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
O00370 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
O00370 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
O00370 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
O00370 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
O00370 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
O00370 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
O00370 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
O00370 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
O00370 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
O00370 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
O00370 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
O00370 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
O00370 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
O00370 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms