Protein–RNA interactions for Protein: O00305

CACNB4, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4O00305 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB4O00305 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB4O00305 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms