Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARVCFO00192 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARVCFO00192 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms