Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN8O00124 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms