Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QRE1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QRE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QRE1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QRE1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QRE1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QRE1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QRE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QRE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QRE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QRE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QRE1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QRE1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QRE1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QRE1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms