Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8VP50 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8VP50 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8VP50 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
F8VP50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8VP50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F8VP50 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
F8VP50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8VP50 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8VP50 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8VP50 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F8VP50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8VP50 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8VP50 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8VP50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8VP50 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F8VP50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F8VP50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F8VP50 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms