Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L5A8MUK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L5A8MUK1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms