Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD3A6NKT7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD3A6NKT7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD3A6NKT7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms