Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85CA6NKD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85CA6NKD9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms