Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
STRCP1A6NGW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCP1A6NGW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
STRCP1A6NGW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms