Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3AA6NCI4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA3AA6NCI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA3AA6NCI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms