Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSAPA4D1B5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSAPA4D1B5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSAPA4D1B5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms