Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRAMEF22A3QJZ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1816 ms