Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC78A2IDD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC78A2IDD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms