Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE3A1L190 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE3A1L190 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms