Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM223A0PJW6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM223A0PJW6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM223A0PJW6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms