Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA3Q9UI47 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms