Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms