Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms