Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms