Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms