Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC24A5-202ENST00000449382 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAC1-201ENST00000319273 1239 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00370-201ENST00000455487 698 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms