Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms