Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDFIP1Q9BT67 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms