Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALPK3Q96L96 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK3Q96L96 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms