Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms