Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGF29Q96ES7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms