Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG3Q8WXD2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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