Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms