Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD1Q8NHV4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD1Q8NHV4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms