Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SPC24Q8NBT2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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SPC24Q8NBT2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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