Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC00269Q8N2A0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC00269Q8N2A0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC00269Q8N2A0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00269Q8N2A0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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LINC00269Q8N2A0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00269Q8N2A0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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