Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP45Q70EL2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP45Q70EL2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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