Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TSSK4Q6SA08 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms