Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf135Q5VTT2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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