Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms