Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL096817.1-201ENST00000623904 1775 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP003469.4-201ENST00000565617 2825 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms