Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LIN52Q52LA3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms