Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms