Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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