Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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