Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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