Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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