Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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