Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TAF1AQ15573 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms