Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms